Durissimo da contrastare è, come dice il nome stesso, il Clostridium Difficile. Già presente nel corpo umano nella flora batterica può sviluppare alcune forme patogene gravi da combattere attraverso antibiotici. Questi, se hanno successo, rischiano però di debilitare il corpo eliminando anche gli altri batteri benigni; se invece vi sono complicanze il batterio può provocare la morte dell'individuo, bucando le pareti intestinali.